Hijo no reconocido para salir de chile

Aun no estoy del todo segura pero si hay un hijo menor de edad no reconocido legalmente por el padre solo la madre, es decir en el certificado de nacimiento aparece nombre del hijo apellido del padre apellido de la madre. Es necesario realizar alguna gestión adicional para salir del país. Se supone que la patria potestad la tiene quien esta a cardo del menor en ausencia del padre.
La pregunta es: ¿ porque no permitieron la salida del menor del país?